В районе Братеево хорошо развита транспортная инфраструктура. Территория связана автодорогами с районами Марьино, Москворечье-Сабурово и Зябликово. Двигаясь по Бесединскому шоссе в сторону области, можно попасть на МКАД (в районе 19 км). Основная автомагистраль района Братеево — это улица Борисовские Пруды.
Также в районе расположено две станции московского метрополитена: «Борисово» и «Алма-Атинская». Напомним, что до 2 декабря 2011 года ближайшей для братеевцев была станция «Марьино», которая расположена на другом берегу Москвы-реки.
По территории района проходит 12 автобусных маршрутов:
— №128: метро «Алма-Атинская» — метро «Марьино» (до 21:00);
— №280: метро «Каширская» — метро «Люблино»;
— №619: метро «Алма-Атинская» — метро «Люблино»;
— №623: метро «Красногвардейская» — метро «Текстильщики»;
— №738: метро «Алма-Атинская» — Метро «Каширская»;
— №740: метро «Алма-Атинская» — «платформа Москворечье»;
— №742: метро «Алма-Атинская» — метро «Нагатинская»;
— №764: метро «Алма-Атинская» — метро «Борисово»;
— №765: «Братеево» — метро «Орехово»;
— №899: «Южные ворота» — метро «Алма-Атинская» (с 6:00 до 23:00);
— №1063: Дзержинский — Москва;
— Н5: Каширское шоссе, 148 — Лубянская площадь.
На данный момент в районе Братеево железнодорожных станций нет, ближайшая — платформа «Москворечье» Курского направления МЖД.
Также, недалеко от пересечения улицы Борисовские Пруды и Ключевой улицы находится пристань «Братеево». От нее в летний сезон регулярно ходят речные теплоходы, с помощью которых можно добраться до района Марьино и парка «Коломенское».